はじめに rjagsでMCMCするときに参考にしたリンクまとめました。忘備録的な側面も兼ねています。 スライド http://cse.fra.affrc.go.jp/okamura/memo/biologging.pdf 様々なバイオロギングのデータ解析の手法を簡単に解説しており、がっつり論文を読む前にイ…

はじめに その2では、rjagsでMCMCするところまでを紹介しました。今回はMCMCサンプリングの結果をプロットし、推定結果が妥当かどうか確かめます。 推定値を取り出す MCMCサンプリングの結果から推定値のデータを取り出す方法には、以下のようにします。 # …

はじめに 今回はその1で作成したモデルを読み込んで、rjagsでMCMCサンプリングを実施するところまでを紹介します。 テストデータの作成 テストデータは以下のように作成しました。 Generate sample data for SCRW-model rjagsで動物の移動モードと真の位置の…

はじめに 動物の移動はGPS発信機を装着し、位置取得することは可能です。しかし、その時に何をしていたのかということは分かりません。 また、GPSで取得した位置は計算過程やノイズによって誤差が生じ、本当にいた位置とは異なります。特にGPSで取得した動物…